แม้จะมีข้อได้เปรียบถุงกระดาษซีเมนต์มีข้อเสียเปรียบหลักที่จำกัดการใช้งานในบางสถานการณ์:
ต้านทานความชื้นต่ำ
แม้จะมีไลเนอร์/สารเคลือบ กระดาษก็ไม่สามารถกันน้ำได้เต็มที่-การสัมผัสกับฝนหรือความชื้นเป็นเวลานานจะทำให้กระดาษเปียก ทำให้เกิดน้ำตาและซีเมนต์ชุ่มชื้น
ความทนทานต่ำ
กระดาษฉีกขาดได้ง่ายหากถูกเจาะ (เช่น ด้วยเครื่องมือมีคมในสถานที่ก่อสร้าง) หรือมีการโหลดมากเกินไป (ถุงไม่สามารถรับน้ำหนักได้อย่างปลอดภัยเกิน 50 กก.)
ความไร้ประสิทธิภาพจำนวนมาก
การขนส่งปูนซีเมนต์ 1 ตันต้องใช้ถุงกระดาษขนาด 20 x 50 กก.- ซึ่งมีประสิทธิภาพน้อยกว่ากระสอบขนาดใหญ่ 1 กระสอบ (ซึ่งบรรจุได้ 1-2 ตัน) ทำให้ต้นทุนการขนส่งเพิ่มขึ้นสำหรับโครงการขนาดใหญ่
ใช้ครั้งเดียว-
ถุงกระดาษส่วนใหญ่ได้รับการออกแบบสำหรับการใช้งานครั้งเดียว (กระดาษจะอ่อนตัวลงหลังจากการเติม/เทออก และไลเนอร์มักจะได้รับความเสียหายเมื่อเปิด)


